Przewiń do zawartości
+48 17 875 13 00office@softsystem.ploffice@softsystem.pl
Facebook page opens in new windowLinkedin page opens in new windowInstagram page opens in new windowYouTube page opens in new window
  • PL
  • EN
Języki_PL
SoftSystem: Information Management Systems for Laboratories
Just another WordPress site
SoftSystem: Information Management Systems for LaboratoriesSoftSystem: Information Management Systems for Laboratories
  • Start
    • O nas
    • Partnerzy
    • Certyfikaty
    • Polityka jakości
    • Polityka prywatności i polityka cookies firmy SoftSystem Sp. z o.o
  • Produkty
    • LIMS
    • Biobank
    • QMS
    • NGS Console
    • Genetics ISS
    • SoftGenePortal
    • SoftPath
    • DataPortal
    • WebDMI
  • Kariera
    • Rekrutacja
    • Oferty pracy
      • Oferty pracy IT – Rzeszów
      • Oferty pracy IT – Lublin
  • Fundusze UE
  • News
  • Kontakt
Szukaj:
  • Start
    • O nas
    • Partnerzy
    • Certyfikaty
    • Polityka jakości
    • Polityka prywatności i polityka cookies firmy SoftSystem Sp. z o.o
  • Produkty
    • LIMS
    • Biobank
    • QMS
    • NGS Console
    • Genetics ISS
    • SoftGenePortal
    • SoftPath
    • DataPortal
    • WebDMI
  • Kariera
    • Rekrutacja
    • Oferty pracy
      • Oferty pracy IT – Rzeszów
      • Oferty pracy IT – Lublin
  • Fundusze UE
  • News
  • Kontakt
Jesteś tutaj:
  1. Strona główna
  2. Nowe technologie
  3. System przetwarzania danych NGS

System przetwarzania danych NGS

Duży postęp w zakresie analizy genomiczej sprawił, że zajmujące się nią laboratoria korzystają obecnie z sekwencjonowania nowej generacji (NGS). To skuteczna i efektywna metoda umożliwiająca jednoczesne odczytywanie milionów fragmentów sekwencji DNA. By móc z niej skorzystać, należy dysponować specjalistycznym oprogramowaniem do przetwarzania danych NGS, którego wdrożeniem mogą zająć się specjaliści z SoftSystem. Sprawdź już teraz, jakie są możliwości oferowanego systemu oraz dlaczego warto postawić na nasze rozwiązania!

Jakie są zalety stosowania technologii NGS do analizy sekwencjonowania DNA?

Nowoczesną technologię NGS uznaje się dziś za podstawowe narzędzie do analiz z zakresu biologii molekularnej. Porównując je do tradycyjnych metod sekwencjonowania DNA, pośród najważniejszych jego zalet należy wymienić:

• niezwykle wysoką precyzję działania,

• możliwość optymalizacji kosztów prowadzenia laboratorium,

• wyjątkową wydajność, która przyczynia się do znaczącego skrócenia czasu przeznaczanego na wykonanie analizy genomicznej.

W wyniku sekwencjonowania DNA generowane są ogromne ilości danych, których analiza jest czasochłonnymi i trudnym procesem wymagającym nierzadko specjalistycznej wiedzy bioinformatycznej. Oferowany przez nas system NGS stanowi doskonałe wsparcie dla tego procesu. Dlaczego warto korzystać z takich narzędzi informatycznych?

Jakie są możliwości systemu przetwarzania danych NGS Console od SoftSystem?

Oferowane przez naszą firmę narzędzia świetnie sprawdzają się w laboratoriach pracujących z dużymi bazami danych. Zaawansowane technologicznie oprogramowanie umożliwia jednoczesne wykonywanie wielu analiz sekwencjonowania DNA. W efekcie znacząco skraca się czas upływający od pobrania próbki do przygotowania raportu końcowego z badania. Pomimo automatyzacji procesów, pracownicy placówki laboratoryjnej mogą kontrolować przetwarzanie danych. System NGS Console cechuje się modułową architekturą, co czyni go bardzo uniwersalnym narzędziem. Świetnie nadaje się do laboratoriów zajmujących się sekwencjonowaniem genomowym lub eksomowym. NGS Console posiada zintegrowane powszechnie stosowane pakiety bioinformatyczne takie jak:

• GATK,

• Picard,

• SAMTools,

• FASTQC.

System umożliwia również integrowanie dodatkowych narzędzi i algorytmów bioinformatycznych.

Jakie są korzyści z wdrożenia systemu przetwarzania danych NGS?

Możliwości wykorzystania nowoczesnej technologii NGS zależą od stosowanego oprogramowania. Nasze narzędzia gwarantują, że analiza sekwencjonowania DNA będzie precyzyjna, szybka i stosunkowo tania. Korzyści płynące ze wdrożenia rozwiązań informatycznych od SoftSystem, to m.in.:

• dostęp do rozbudowanych możliwości systemu przetwarzania danych NGS

• efektywniejsza praca laboratorium,

• skuteczna kontrola jakości na poziomie próbki oraz przetwarzania danych.

Możliwości oprogramowania NGS Console

Kluczową funkcją systemu przetwarzania danych NGS jest wykrywanie wariantów genetycznych dla określonego fenotypu. Można je dowolnie filtrować, stosując dopasowane do potrzeb kryteria.

Oprócz tego oprogramowanie do przetwarzania danych NGS zostało stworzone z myślą o integracji z systemem LIMS. To zestaw profesjonalnych narzędzi przeznaczonych m.in. do planowania pracy w laboratorium i nadzorowania jej. Korzyścią z takiego połączenia będzie np. możliwość bezpośredniego przekazywania zamówień na badania poprzez wbudowaną konsolę.

Efektywniejsza praca laboratorium

Nowoczesne algorytmy zastosowane w NGS Console mogą równolegle przeprowadzać wiele analiz DNA. To oszczędność czasu, która jest także efektem automatycznego generowania raportów końcowych CVS. Do tego użytkownicy systemu mogą pobierać pliki wyjściowe z danymi w różnych popularnych formatach, w tym:

• BAM,

• BAI,

• VCF.

Na zwiększenie wydajności pracy laboratorium wpływa także funkcja planowania analiz danych z sekwencjonowania NGS. Oprogramowanie umożliwia ich kolejkowanie pod kątem określonych wcześniej priorytetów.

Wysoka jakość analizy sekwencjonowania DNA

Z punktu widzenia laboratorium, najważniejsza jest zawsze jakość wykonanej analizy sekwencjonowania DNA. NGS Console zapewnia nadzór nad kontrolą jakości analizowanych danych zarówno na poziomie całego procesu jak i pojedynczej próbki.

System oferuje szerokie możliwości konfigurowania różnych parametrów związanych z kontrolą jakości. Zalicza się do nich między innymi:

• rozkład długości sekwencji i poziomy ich powielania,

• określenie maksymalnej zawartości par GC,

• zawartość adaptera.

Jedną z funkcjonalności systemu jest możliwość ustawienia parametrów jakości sekwencjonowania. W razie ich przekroczenia, użytkownik musi podjąć decyzję o kontynuowaniu lub przerwaniu analizy.

Postaw na nowoczesny system przetwarzania danych NGS Console!

Prowadzisz laboratorium, w którym każdego dnia przetwarza się ogromne ilości danych z sekwencjonowania DNA? W takim razie zdecydowanie powinieneś stawiać na rozwiązania usprawniające pracę z nimi. Jeśli Twoja placówka specjalizuje się w analizie sekwencjonowania DNA, zapoznaj się z naszą ofertą. NGS Console to nowoczesny, bardzo funkcjonalny i do tego prosty w obsłudze system przetwarzania danych NGS. Za jego przygotowanie oraz rozwój odpowiedzialny jest zespół doświadczonych programistów i testerów. Skontaktuj się z nami już dziś – zajmiemy się kompleksowym wdrożeniem narzędzi informatycznych i ich konfiguracją!

Kategorie
  • Centrum B&R(13)
  • Cytometr(1)
  • Fundusze UE(14)
  • Goście(1)
  • Ludzie(5)
  • Nowe technologie(10)
  • Pomocna dłoń(1)
Ostatnie wpisy
  • Od Testera do Managera – poznajcie Zbyszka, który jest Global Implementation Team Managerem w naszej firmie
    9 lutego, 2022
  • Jak praca stała się pasją – poznajcie Waldka, Lidera zespołu Programistów Testów Automatycznych
    1 grudnia, 2021
  • Poznajcie Marka – menedżera zespołu DMI Development
    29 października, 2021

MENU

  • PRODUKTY
  • OFERTY PRACY
  • FUNDUSZE UE
  • NEWS
  • KONTAKT

CERTYFIKATY:
ISO 9001:2015
PN-EN ISO 13485:2012
PN-EN 62304:2010

SIEDZIBA FIRMY

ul. Leszka Czarnego 6A • 35-615 Rzeszow • Polska

ODDZIAŁ FIRMY

ul. Wojciechowska 9C • 20-704 Lublin • Polska

office@softsystem.pl

+48 17 875 13 00

SOCIAL MEDIA

Zarządzaj zgodami plików cookie
Aby zapewnić jak najlepsze wrażenia, korzystamy z technologii, takich jak pliki cookie, do przechowywania i/lub uzyskiwania dostępu do informacji o urządzeniu. Zgoda na te technologie pozwoli nam przetwarzać dane, takie jak zachowanie podczas przeglądania lub unikalne identyfikatory na tej stronie. Brak wyrażenia zgody lub wycofanie zgody może niekorzystnie wpłynąć na niektóre cechy i funkcje.
Funkcjonalne Zawsze aktywne
Przechowywanie lub dostęp do danych technicznych jest ściśle konieczny do uzasadnionego celu umożliwienia korzystania z konkretnej usługi wyraźnie żądanej przez subskrybenta lub użytkownika, lub wyłącznie w celu przeprowadzenia transmisji komunikatu przez sieć łączności elektronicznej.
Preferencje
Przechowywanie lub dostęp techniczny jest niezbędny do uzasadnionego celu przechowywania preferencji, o które nie prosi subskrybent lub użytkownik.
Statystyka
Przechowywanie techniczne lub dostęp, który jest używany wyłącznie do celów statystycznych. Przechowywanie techniczne lub dostęp, który jest używany wyłącznie do anonimowych celów statystycznych. Bez wezwania do sądu, dobrowolnego podporządkowania się dostawcy usług internetowych lub dodatkowych zapisów od strony trzeciej, informacje przechowywane lub pobierane wyłącznie w tym celu zwykle nie mogą być wykorzystywane do identyfikacji użytkownika.
Marketing
Przechowywanie lub dostęp techniczny jest wymagany do tworzenia profili użytkowników w celu wysyłania reklam lub śledzenia użytkownika na stronie internetowej lub na kilku stronach internetowych w podobnych celach marketingowych.
Zarządzaj opcjami Manage services Zarządzaj dostawcami Przeczytaj więcej o tych celach
Zobacz preferencje
{title} {title} {title}